Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. ESET Nod32 Antivirus ondersteunt minimaal 25 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die ESET Nod32 Antivirus ondersteunt zijn .NUP. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in ESET Nod32 Antivirus op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door ESET Nod32 Antivirus.
ESET Nod32 Antivirus kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via ESET Nod32 Antivirus en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door ESET Nod32 Antivirus.