Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. ERDAS ER Mapper ondersteunt minimaal 3 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die ERDAS ER Mapper ondersteunt zijn .ALG. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in ERDAS ER Mapper op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door ERDAS ER Mapper.
ERDAS ER Mapper kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via ERDAS ER Mapper en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door ERDAS ER Mapper.