Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. EDIUS ondersteunt minimaal 6 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die EDIUS ondersteunt zijn .MTS. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in EDIUS op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door EDIUS.
EDIUS kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via EDIUS en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door EDIUS.