Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. DVBPortal MP4Muxer ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die DVBPortal MP4Muxer ondersteunt zijn .CHAP. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in DVBPortal MP4Muxer op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door DVBPortal MP4Muxer.
DVBPortal MP4Muxer kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via DVBPortal MP4Muxer en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door DVBPortal MP4Muxer.