Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Digita Organiser ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Digita Organiser ondersteunt zijn .DOR. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Digita Organiser op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Digita Organiser.
Digita Organiser kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Digita Organiser en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Digita Organiser.