Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. darktable ondersteunt minimaal 30 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die darktable ondersteunt zijn .CR2. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in darktable op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door darktable.
darktable kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via darktable en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door darktable.