Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Creatures 3 ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Creatures 3 ondersteunt zijn .C16. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Creatures 3 op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Creatures 3.
Creatures 3 kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Creatures 3 en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Creatures 3.