Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Cortona3D Viewer ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Cortona3D Viewer ondersteunt zijn .WRL. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Cortona3D Viewer op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Cortona3D Viewer.
Cortona3D Viewer kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Cortona3D Viewer en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Cortona3D Viewer.