Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Comic Zeal ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Comic Zeal ondersteunt zijn .CBR. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Comic Zeal op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Comic Zeal.
Comic Zeal kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Comic Zeal en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Comic Zeal.