Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Code::Blocks ondersteunt minimaal 8 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Code::Blocks ondersteunt zijn .C. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Code::Blocks op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Code::Blocks.
Code::Blocks kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Code::Blocks en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Code::Blocks.