Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Code Crusader ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Code Crusader ondersteunt zijn .JCC. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Code Crusader op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Code Crusader.
Code Crusader kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Code Crusader en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Code Crusader.