Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. CNwin ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die CNwin ondersteunt zijn .CN. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in CNwin op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door CNwin.
CNwin kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via CNwin en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door CNwin.