Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. CD Catalog Expert ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die CD Catalog Expert ondersteunt zijn .ZDC. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in CD Catalog Expert op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door CD Catalog Expert.
CD Catalog Expert kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via CD Catalog Expert en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door CD Catalog Expert.