Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Cashflow Manager ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Cashflow Manager ondersteunt zijn .BC6. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Cashflow Manager op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Cashflow Manager.
Cashflow Manager kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Cashflow Manager en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Cashflow Manager.