Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. CARIS GIS Professional ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die CARIS GIS Professional ondersteunt zijn .IGA. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in CARIS GIS Professional op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door CARIS GIS Professional.
CARIS GIS Professional kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via CARIS GIS Professional en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door CARIS GIS Professional.