Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Capture One ondersteunt minimaal 5 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Capture One ondersteunt zijn .IIQ. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Capture One op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Capture One.
Capture One kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Capture One en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Capture One.