Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Caphyon Advanced Installer ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Caphyon Advanced Installer ondersteunt zijn .AIU. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Caphyon Advanced Installer op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Caphyon Advanced Installer.
Caphyon Advanced Installer kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Caphyon Advanced Installer en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Caphyon Advanced Installer.