Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Box Sync ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Box Sync ondersteunt zijn .WEBDOC. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Box Sync op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Box Sync.
Box Sync kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Box Sync en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Box Sync.