Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Bookmarks by Keywords ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Bookmarks by Keywords ondersteunt zijn .BKY. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Bookmarks by Keywords op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Bookmarks by Keywords.
Bookmarks by Keywords kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Bookmarks by Keywords en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Bookmarks by Keywords.