Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Bob the Builder: Can do Zoo ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Bob the Builder: Can do Zoo ondersteunt zijn .BOBTHEBUILDERSAVEDGAME. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Bob the Builder: Can do Zoo op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Bob the Builder: Can do Zoo.
Bob the Builder: Can do Zoo kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Bob the Builder: Can do Zoo en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Bob the Builder: Can do Zoo.