Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Bejeweled 2 ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Bejeweled 2 ondersteunt zijn .BEJEWELED2DELUXESAVEDGAME. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Bejeweled 2 op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Bejeweled 2.
Bejeweled 2 kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Bejeweled 2 en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Bejeweled 2.