Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Bamboo Paper ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Bamboo Paper ondersteunt zijn .BAMBOOPAPER. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Bamboo Paper op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Bamboo Paper.
Bamboo Paper kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Bamboo Paper en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Bamboo Paper.