Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Apple Jar Launcher ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Apple Jar Launcher ondersteunt zijn .CLASS. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Apple Jar Launcher op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Apple Jar Launcher.
Apple Jar Launcher kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Apple Jar Launcher en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Apple Jar Launcher.