Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. App-V Sequencer ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die App-V Sequencer ondersteunt zijn .SFT. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in App-V Sequencer op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door App-V Sequencer.
App-V Sequencer kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via App-V Sequencer en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door App-V Sequencer.