Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. APM Graph ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die APM Graph ondersteunt zijn .AGR. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in APM Graph op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door APM Graph.
APM Graph kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via APM Graph en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door APM Graph.