Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. AnetHelpTool ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die AnetHelpTool ondersteunt zijn .ATB. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in AnetHelpTool op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door AnetHelpTool.
AnetHelpTool kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via AnetHelpTool en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door AnetHelpTool.