Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Altair HyperStudy ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Altair HyperStudy ondersteunt zijn .HSTX. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Altair HyperStudy op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Altair HyperStudy.
Altair HyperStudy kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Altair HyperStudy en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Altair HyperStudy.