Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Alphacam ondersteunt minimaal 16 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Alphacam ondersteunt zijn .AFD. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Alphacam op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Alphacam.
Alphacam kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Alphacam en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Alphacam.