Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Aliens versus Predator 2 ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Aliens versus Predator 2 ondersteunt zijn .ED. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Aliens versus Predator 2 op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Aliens versus Predator 2.
Aliens versus Predator 2 kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Aliens versus Predator 2 en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Aliens versus Predator 2.