Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Aleph One ondersteunt minimaal 10 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Aleph One ondersteunt zijn .SCEA. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Aleph One op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Aleph One.
Aleph One kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Aleph One en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Aleph One.