Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Advanced Excel Repair ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Advanced Excel Repair ondersteunt zijn .XLS. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Advanced Excel Repair op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Advanced Excel Repair.
Advanced Excel Repair kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Advanced Excel Repair en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Advanced Excel Repair.