Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Advanced ETL Processor ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Advanced ETL Processor ondersteunt zijn .ATS. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Advanced ETL Processor op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Advanced ETL Processor.
Advanced ETL Processor kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Advanced ETL Processor en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Advanced ETL Processor.