Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Adobe Atmosphere ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Adobe Atmosphere ondersteunt zijn .AER. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Adobe Atmosphere op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Adobe Atmosphere.
Adobe Atmosphere kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Adobe Atmosphere en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Adobe Atmosphere.