Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. 4DOS ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die 4DOS ondersteunt zijn .4SW. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in 4DOS op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door 4DOS.
4DOS kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via 4DOS en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door 4DOS.