Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. 4-MP3 ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die 4-MP3 ondersteunt zijn .4MP. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in 4-MP3 op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door 4-MP3.
4-MP3 kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via 4-MP3 en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door 4-MP3.