Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. 3Data Expert ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die 3Data Expert ondersteunt zijn .3DE. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in 3Data Expert op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door 3Data Expert.
3Data Expert kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via 3Data Expert en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door 3Data Expert.