Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Q2ID (Quark To InDesign) ondersteunt minimaal 3 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Q2ID (Quark To InDesign) ondersteunt zijn .INDD. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Q2ID (Quark To InDesign) op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Q2ID (Quark To InDesign).
Q2ID (Quark To InDesign) kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Q2ID (Quark To InDesign) en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Q2ID (Quark To InDesign).