Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Perl Express ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Perl Express ondersteunt zijn .PM. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Perl Express op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Perl Express.
Perl Express kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Perl Express en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Perl Express.